Il Museo Nazionale dell’Antartide è articolato su tre sedi:
- La sede di Genova ha il compito di curare la conservazione del materiale biologico marino e terrestre e dei campioni d’acqua.
- La sede di Siena ha il compito di curare la conservazione del materiale mineralogico, litologico (terrestre ed extraterrestre) e glaciologico.
- La sede di Trieste ha il compito di curare la conservazione della documentazione generale e specifica sulla storia dell’esplorazione in Antartide e del materiale sedimentologico marino.
Per la cura di reperti che necessitano di particolari condizioni per la loro conservazione sono state istituito alcune sedi associate presso le Università di Messina, Trieste, Genova, Tuscia, Milano Bicocca, CNR Bologna.